新格元||为海量单细胞数据探索提供更多可能
海量单细胞测序技术可揭示单个细胞独特的基因表达特征,精细区分细胞亚型,深入研究细胞之间的相互关系。致以广大,因其为通量高,正广泛地应用于肿瘤研究、免疫研究、神经生物学研究及发育研究等领域。致以精微,因其为单细胞,可以从不同侧面揭示组织异质性。
新格元生物科技公司有着专业的生物信息挖掘团队,可提供个性化的定制分析内容,有着丰富的项目经验。值得一提的是,新格元自有的细胞类型marker数据库,可为多种异质性极高的细胞亚群提供精准注释。缩短从Idea 到Fig1的距离,为下游分析提供保障。
在注释结果中包含着的大量信息需要充分解读才能发挥价值。在研究课题的过程中,一些感兴趣的基因,需要经常用可视化手段(Feature Plot)查看他们在细胞中的表达情况。这样的探索工作是确定下游分析对象,引导研究方向,推动课题进展的重要步骤。然而Feature Plot的绘图方法是基于编程语言的,缺少方便用户的交互界面,反复操作起来也很繁琐。针对这一痛点,新格元团队将质控、分群、注释后的结果打包输入到UCSC Cell Browser中进行可视化。
在Cell Browser交互界面中浏览数据,带来四大优势:
打包数据本地运行,无需联网,保证数据安全性 浏览界面操作简单,反复查看多个/单个基因零耗时 支持多样本联合分析结果浏览,实现样本间比对 降维作图方式、着色方式等灵活可调,满足不同期刊的图像需求,支持高清图像保存。
Cell Browser交互界面四大功能:
细胞分群注释结果降维展示 根据注释或marker基因表达情况分选细胞
展示marker基因表达情况
不仅可以在降维图内展示单个基因,还可以展示marker基因在全细胞群中分布
自由调整作图方式
自由选择按基因数目、转录本数目、单个基因表达量着色,作图多种颜色可选,灵活调整
1637年(明崇祯十年)《天工开物》初刊,描绘了当时懵懂的科学技术给农业和手工业带来的变化。随着海量单细胞测序技术的应用,我们相信也会给生命科学基础研究以及临床诊断带来新的可能。
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新格元秉持“格物致知,识微通元”的创新性理念,致力于发展简便可靠的单细胞组学技术,使之成为新一代细胞病理及血液检测手段,让单细胞组学以传统方法无法比拟的精确度、灵敏度和分辨率服务于精准医疗和健康管理等领域。
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